Цистеамін гідрохлорид може бути використаний для виготовлення косметики, кормової добавки, противиразкового препарату, а також для виготовлення біохімічного реагенту та комплексного агента важких іонів м'яса. Він може вступати в реакцію з ферментом людського тіла та стабілізувати його ефективність, коли існує випромінювання, отже, його можна використовувати для лікування променевого синдрому та отрути тетраетилсвинцю. З нього можна зробити таблетки або ін’єкції.