О-фталальдегід є фармацевтичними проміжними сполуками, останнім актуальним безпечним та ефективним дезінфікуючим засобом, як лікарська ендоскопічна хірургічна стерилізація інструменту, для синтезу нового препарату для інгредіювання агрегації тромбоцитів індолу Бофен, а також галузі хімічного аналітичного реагенту. О-фталальдегід в основному використовується в медицині , барвники тощо. Реагент для дериватизації амінокислот, виявлення флуоресценції, реакція за хвилину, але продукт не є стабільним, потрібно негайно виявити.
